چرا پیشگام ژنومیک لی هود امیدوار است که بیماری همه گیر covid-19 داروهای دقیق مبتنی بر اطلاعات شخصی بیمار را به واقعیت تبدیل کند


دیویس بر این باور است که کلید درک این که چرا کوید به روش های مختلف بر روی افراد تأثیر می گذارد ، شناسایی تفاوت بین سیستم ایمنی بدن کسانی است که با موفقیت با این بیماری مبارزه می کنند و کسانی که تسلیم می شوند. این تفاوت ها می تواند از ساده باشد ، مانند اینکه کسی در گذشته در معرض ویروس های مختلف کرونا قرار گرفته باشد ، تا عواملی پیچیده به اندازه تغییرات تعیین شده ژنتیکی در نحوه نمایش برخی سلول ها از پروتئین های ویروسی بر روی سطح خود برای تأیید با سلول های ایمنی در گردش. این پروتئین ها می توانند احتمال اینکه سلول ایمنی وجود یک عامل بیماری زا خطرناک را تشخیص دهد ، زنگ خطر را ایجاد کرده و ارتش آنتی بادی ها را برای ادامه حمله بسیج کنند ، تأثیر بگذارند.

دیویس می گوید: “اکنون یک جریان داده وجود دارد و این بالاترین کیفیتی است که ما تاکنون داشته ایم و همچنین بالاترین کیفیتی است که تاکنون داشته ایم.”

مطمئناً نعمت علم است. اما آیا مطالعه ISB شیوه درمان بیماران را تغییر می دهد و به ما کمک می کند تا برای همه گیری های آینده آماده شویم؟ هود خوش بین است. وی گفت: “این کاملاً همه مواردی را که در طول 20 سال گذشته بحث کرده ام تأیید می کند.”

ابزار لازم

هود در اوایل کار خود پس از تحصیل در دانشکده پزشکی و دریافت درجه دکترا از کلتک ، سهم قابل توجهی در ایمونولوژی داشت. وی به حل این معما کمک کرد که بدن چگونه می تواند تقریباً 10 میلیارد نوع آنتی بادی تولید کند ، پروتئین های Y شکل که می توانند به سطح خارجی پاتوژن متجاوز متصل شوند و آن را با خاصیت یک موشک هدایت شونده نابود کنند.

با وجود موفقیت اولیه ، هود از ابتدا دریافت که بدون پیشرفت عمده در فناوری ، هرگز به جذاب ترین س biologicalالات بیولوژیکی باقی مانده برای سیستم ایمنی بدن پاسخ نخواهد داد: س :الاتی که نشان می دهد چگونه مجموعه فوق العاده پیچیده ای از انواع سلول ها و پروتئین ها را هماهنگ می کند. هود متوجه شد که اگر ایمونولوژیست ها هرگز بفهمند که چگونه همه این قسمت ها با هم کار می کنند ، ابتدا باید آنها را تشخیص ، مشخص و اندازه گیری کنند.

جیم هیت
جیم هیت ، رئیس انستیتوی زیست شناسی سیستم ها

ایان آلن

آزمایشگاه هود Caltech در ایجاد طیف وسیعی از ابزارها ، از جمله ابزارهایی که به زیست شناسان اجازه می دهد توالی اسیدهای آمینه و ماشین آلاتی را که می توانند نوکلئوتیدهای DNA (حروف کد ژنتیکی) را رشته کنند ، نقشی اساسی بازی کرد. شاید از همه معروف تر ، در سال 1986 ، او به اختراع توالی سنج DNA خودکار کمک کرد ، دستگاهی که قادر به سریع خواندن نوکلئوتیدها در ژنوم و تعیین ترتیب آنها است. این راه را برای پروژه ژنوم انسانی هموار کرد ، یک تلاش 13 ساله ، 3 میلیارد دلاری برای ایجاد اولین پیش نویس از یک ژنوم کامل انسانی.

در سالهای بعد ، هود طرفدار کشف مجدد مراقبت های بهداشتی مدرن بود که با استفاده از ابزارهای جدید زیست شناسی مولکولی داده های بیماران جداگانه را جمع آوری می کرد: توالی های ژنومی و موجودی کامل پروتئین های موجود در جریان خون. سپس می توان این داده ها را با استفاده از سیستم های یادگیری اولیه ماشین و شناسایی الگو تجزیه و تحلیل کرد تا الگوها و همبستگی های جالبی را بدست آورد. از بینش می توان برای افزایش سلامت انسان و غلبه بر بیماری خیلی زودتر از گذشته استفاده کرد.

همه چیز معنای کامل علمی داشت. اما تقریباً دو دهه پس از اتمام پروژه ژنوم انسانی در سال 2003 و علیرغم پیشرفتهای چشمگیر در علم ژنومیک و همچنین علم داده ، انقلاب پیش بینی شده بهداشت و درمان هود هنوز اتفاق نیفتاده است.

هود می گوید یکی از دلایل آن گران بودن ابزارها است. با این حال ، می توان ژنوم را با قیمت 300 دلار یا کمتر توالی داد. و او می گوید محققان به ابزارهای محاسباتی دسترسی پیدا کرده اند که “واقعاً می تواند داده ها را ادغام کند و داده ها را به دانش تبدیل کند”.

اما بزرگترین مانع این است که سیستم بهداشت ناکارآمد و در برابر تغییر مقاوم است. هود می گوید: “درک درستی از اهمیت دریافت انواع مختلف داده ها و ادغام آنها وجود ندارد.” “بیشتر پزشكان پنج یا 10 یا 20 سال پیش به دانشكده پزشكی رفتند و هرگز چیزی در این مورد آموختند.”

وی گفت: “همه واقعاً مشغول هستند و جابجایی زمان بر است ، بنابراین شما باید مدیریت و همچنین پزشكان را متقاعد كنید كه به نفع آنها است.” “همه چیز بسیار دشوارتر از آن چیزی بود که من فکر می کردم.”

درس های همه گیر

امروزه ، هود همچنان پافشاری می کند و علی رغم سالها ناامیدی ، او به طور مشخص خوش بین است. یکی از دلایل امیدواری مجدد او این است که وی سرانجام به بیماران و پول آماده دسترسی به آزمایش بزرگ بعدی خود دسترسی دارد.

در سال 2016 ، ISB با Providence Health & Services در سیاتل ادغام شد ، یک شبکه گسترده از 51 بیمارستان ، میلیاردها دلار پول نقد و گرسنگی برای ایجاد یک برنامه تحقیقاتی قوی تر.

اندکی پس از ادغام ، هود با یک کمپین غیر ممکن بلند پروازانه برای راه اندازی پروژه ای به نام “میلیون نفر” صحبت کرد. او بله ، یک میلیون نفر از فنوتیپ و تجزیه و تحلیل ژنتیکی استفاده خواهد کرد. در ژانویه 2020 ، هود پس از استخدام 5000 بیمار و تنظیم ژنوم آنها ، یک طرح آزمایشی را آغاز کرد.


منبع: unbox-khabar.ir

Leave a reply

You may use these HTML tags and attributes: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <s> <strike> <strong>