هزینه های میلیاردی برای سازگاری با پوسته به ما نمی گوید که چگونه گزینه ها را متوقف کنیم


توافقنامه های سازگاری به جای تلاش برای کار بر روی این موضوعات در سطح ملی ، به آژانس های بهداشت عمومی اجازه می دهد نام و اطلاعات تماس افرادی را که برای مشکلات مختلف آزمایش مثبت داده اند ، درخواست کنند. اما این فقط همان مسائل مربوط به مالکیت داده ها را به زنجیره ای سوق می دهد.

برایان کروگر از Labcorp گفت: “برخی از ایالت ها بسیار خوب هستند و می خواهند درباره گزینه هایی که در ایالت آنها گسترش می یابد اطلاعات زیادی کسب کنند.” “کشورهای دیگر نیستند.”

اپیدمیولوژیست های بهداشت عمومی اغلب با استفاده از نرم افزاری برای تجزیه و تحلیل مجموعه داده های بزرگ مانند توالی های ژنومیک ، تجربه کمی در زمینه بیوانفورماتیک دارند. فقط تعداد کمی از آژانس ها برنامه تعیین توالی دارند. حتی اگر این کار را انجام دهند ، با تجزیه و تحلیل هر بخش قضایی فقط بخش کوچکی از مجموعه داده ها ، این میزان دانش را در مورد رفتارهای دنیای واقعی به دست می آورد.

عبور از این موضوعات – تسهیل پیوند توالی ها و فراداده های کلینیکی در مقیاس بزرگ – به مواردی غیر از اصلاحات اساسی و کلیدی قوانین محرمانه احتیاج دارد. سازماندهی مجدد کل سیستم بهداشت و درمان و بهداشت عمومی در ایالات متحده ضروری خواهد بود ، جایی که هر یک از 64 آژانس بهداشت عمومی به عنوان شهرکهای فئودالی فعالیت می کنند و هیچ تمرکز اطلاعات و قدرت وجود ندارد.

جاناتان کوئیک ، مدیر عامل واکنش ، آمادگی و پیشگیری از بیماری همه گیر در بنیاد راکفلر گفت: “فراداده ها بزرگترین هسته شکستنی نیستند.” (بنیاد راکفلر به ما کمک می کند تا در بررسی فناوری MIT بودجه را پوشش دهیم ، اگرچه هیچ نظارت تحریریه وجود ندارد.) از آنجا که جمع آوری مجموعه داده های کافی به اندازه کافی برای درک واقعی رفتارهای واقعی برای بهداشت عمومی بسیار دشوار است ، درک ما باید از تولید کنندگان واکسن باشد او می گوید و بیمارستان ها توالی را به آزمایشات بالینی خود اضافه می کنند.

ناامیدکننده است که بسیاری از مجموعه های گسترده اطلاعات مفید از قبل در پرونده های الکترونیکی پزشکی ، سوابق ایمن سازی و سایر منابع وجود دارد ، اما به راحتی قابل استفاده نیست.

سریع می گوید: “چیزهای زیادی وجود دارد که می توان سریعتر یاد گرفت و یاد گرفت بدون اینکه غل و زنجیری که ما برای استفاده از این داده ها گذاشته ایم ، باشد.” “ما فقط نمی توانیم برای نظارت بر شرکت های واکسن سازی اعتماد کنیم.”

افزایش بیوانفورماتیک در سطح دولت

اگر انتظار می رود آزمایشگاه های بهداشت عمومی بیشتر روی ردیابی و درک گزینه ها متمرکز شوند ، به همه کمکی که می توانند بگیرند نیاز دارند. انجام کاری در مورد گزینه ها در یک مورد فردی در نهایت مسئله بهداشت عمومی است ، در حالی که انجام کاری در مورد گزینه ها در سطح سیاسی سیاسی است.

آزمایشگاه های بهداشت عمومی معمولاً از ژنومیک برای افشای اطلاعات پنهان در مورد شیوع بیماری یا به عنوان بخشی از تلاش برای ردیابی استفاده می کنند. در گذشته از توالی برای ارتباط شیوع E. coli با مزارع خاص ، شناسایی و ایجاد اختلال در زنجیره انتقال HIV ، جداسازی موارد ابولا در ایالات متحده و پیگیری الگوهای سالانه آنفلوانزا استفاده شده است.

حتی کسانی که برنامه های کاملاً مطلوبی دارند تمایل دارند که ژنومیک را به میزان کم استفاده کنند. هزینه سازگاری طی دهه گذشته به شدت کاهش یافته است ، اما این روند هنوز ارزان نیست ، به ویژه برای بخش های بهداشتی ایالتی و محلی محروم از پول. هزینه خرید و بهره برداری از این ماشین ها صدها هزار دلار است: ایلومینا ، یكی از بزرگترین تولید كنندگان تجهیزات توالی یابی ، می گوید آزمایشگاه ها سالانه به طور متوسط ​​1.2 میلیون دلار برای هر یك از دستگاه های خود هزینه می كنند.

“اگر فقط به بخش های بهداشتی پول بدهیم تا برنامه هایی بدون استراتژی فدرال ایجاد کنیم ، بنابراین همه می دانند چه کاری انجام می دهند ، فرصت های زیادی را از دست خواهیم داد.”

آژانس های بهداشتی فقط به پول احتیاج ندارند. آنها همچنین نیاز به تجربه دارند. نظارت برای تبدیل رشته های طولانی حروف به دنباله ای از اطلاعات مفید و همچنین افراد برای توضیح نتایج کارمندان و ترغیب آنها به تبدیل همه درس های آموخته شده به سیاست ، به اطلاعات زیستی بسیار واجد شرایط احتیاج دارد.

خوشبختانه ، OAMD تلاش می کند تا از بخشهای بهداشتی ایالتی و محلی حمایت کند زیرا آنها سعی می کنند داده های سازگاری خود را با استخدام بیوانفورماتیک منطقه ای برای مشاوره با مقامات بهداشت عمومی درک کنند و تلاش آژانس ها را برای به اشتراک گذاشتن تجربیات خود درک کنند.

او همچنین صدها میلیون سرمایه در ساخت و پشتیبانی از برنامه های تعیین توالی خود برای این سازمان ها – نه فقط برای کووید ، بلکه برای همه عوامل بیماری زا – می ریزد.

اما بسیاری از این آژانس ها برای رتبه بندی هر چه بیشتر ژنوم های پوستی تحت فشار هستند. بدون داشتن یک استراتژی منسجم برای جمع آوری و تجزیه و تحلیل داده ها ، مشخص نیست که این برنامه ها چقدر مفید خواهند بود.

وارمبرود گفت: “اگر فقط به بخش های بهداشتی پول بدهیم تا برنامه هایی بدون استراتژی فدرال ایجاد كنند ، بنابراین همه می دانند كه چه کاری انجام می دهند ، فرصت های زیادی را از دست خواهیم داد.”

چشم اندازهای اولیه غصب شده است

مارک پاندوری مدیر آزمایشگاه بهداشت عمومی در نوادا ، یکی از برنامه هایی است که OAMD پشتیبانی می کند. او سالهاست كه از حامیان جدی مشاهده ژنومی است. او قبل از انتقال به رینو ، یک آزمایشگاه بهداشت عمومی را در شهرستان آلامدا ، کالیفرنیا اداره کرد و در آنجا به یک پیشگام در یک برنامه تعیین توالی برای ردیابی عفونت در اطراف بیمارستان ها کمک کرد.

وی می گوید ، ترجمه توالی ها به داده های قابل استفاده بزرگترین چالش برای برنامه های بهداشت عمومی ژنومی است.

“CDC می تواند بگوید ،” یک دسته تجهیزات ترتیب سنجی بخر ، یک سری دنباله بساز. ” اما این هیچ کاری نمی کند مگر اینکه کاربران این داده ها نحوه استفاده از آن را بلد نباشند و نحوه استفاده از آن را نمی دانند. ” “من با شما در مورد رباتیک صحبت می کنیم که هر روز برای نظم بخشیدن به آن نیاز داریم ، اما بخش های بهداشت فقط به یک روش آسان برای فهمیدن ارتباط این موارد نیاز دارند.

از نظر گزینه ها ، آزمایشگاه های بهداشت عمومی تحت همان فشارهایی قرار دارند که CDC با آن روبرو است: همه می خواهند بدانند که چه گزینه هایی در حال انتشار است ، آیا می توانند کاری را با اطلاعات انجام دهند یا خیر.

Pandora برنامه توالی Covid خود را به امید کاهش کار مورد نیاز برای بررسی شیوع بالقوه Covid با شناسایی سریع یا مرتبط بودن یا تصادفی بودن موارد نزدیک به یکدیگر ، آغاز کرد.

آزمایشگاه وی اولین آزمایش در آمریکای شمالی بود که یک بیمار مبتلا به covid-19 را مجدداً آلوده کرد و بعداً نوع B.1.351 را در یک بیمار بستری که به تازگی از آفریقای جنوبی برگشته بود ، پیدا کرد. با ردیابی سریع تماس ها ، بخش بهداشت موفق شد از شیوع آن جلوگیری کند.


منبع: unbox-khabar.ir

Leave a reply

You may use these HTML tags and attributes: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <s> <strike> <strong>